Dezembro, 2009
115
Passo Fundo, RS

V Mostra de Iniciação Científica Embrapa Trigo

Resumos



Sessão de Biotecnologia, Melhoramento e Fitossanidade

BUSCA DE SEQUÊNCIAS RELACIONADAS A ESTRESSES BIÓTICOS E ABIÓTICOS

Saggiorato, S.1; Nhani Junior, A.2*

O Projeto Melhoramento Genético de Trigo para o Brasil, conduzido pela Embrapa Trigo, busca solucionar problemas relacionados a estresses bióticos e abióticos, que causam a diminuição da produção e conseqüente aumento da importação deste grão. São gastos cerca de 800 milhões de dólares anualmente, já que é produzida somente 40% da demanda deste cereal. Na região Sul do país, os fatores que afetam a produtividade são principalmente clima (relacionado à germinação na espiga), solo (toxicidade por alto índice de alumínio) e doenças como ferrugem da folha e giberela. Com o uso de ferramentas de bioinformática buscamos encontrar, em trigo, seqüências similares aos genes de resistência relacionados a estes fatores. Para isso, pesquisando o banco de dados do NCBI-GenBank, foi possível encontrar seqüências de genes de arroz relacionadas aos estresses. Em seguida, foi realizada busca de similaridade com auxílio do programa Blast (N para nucleotídeos e X para peptídeos) dessas seqüências contra trigo. Para cada seqüência analisada, foram separados os melhores resultados, tomando como base os parâmetros de mais alto score e valor esperado (e-value) limitado a e-80 para BlastN e e-20 para BlastX. Os melhores resultados foram filtrados e compostos em uma tabela, separados por estresse. Para resistência a Al, foram encontradas 35 seqüências em BlastN e 34 em BlastX; para giberela 3 seqüências em BlastN e 2 em BlastX; para ferrugem da folha 33 seqüências em BlastN e em BlastX, e para germinação na espiga 3 seqüências em BlastN e em BlastX. Em seguida, as seqüências nucleotídicas selecionadas foram recuperadas e submetidas à análise da presença de repetições de seqüências simples (SSRs). Das 72 seqüências analisadas, 49 apresentam SSRs, sendo 25 o número de seqüências contendo tri-nucleotídeos. Entre estas últimas serão selecionadas seqüências para o desenho de iniciadores de síntese, que por sua vez serão utilizados para a amplificação de seqüências em trigo, na busca de marcadores moleculares que possam ser utilizados em seleção assistida.

1 Acadêmico do curso de Agronomia, Universidade de Passo Fundo. Bolsista Embrapa Trigo.
2 Pesquisador da Embrapa Trigo, *orientador.

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